Nasceu em Luanda em 1974. Em 1997 concluiu o curso de Cinema na área de Montagem da Escola Superior de Teatro e Cinema de Lisboa. Em 1998 fundou a produtora O Som e a Fúria. Em 20 anos, realizou 14 curtas-metragens. Os seus filmes ganharam prémios em festivais como a Bienal de Veneza, Gijón, Oberhausen e Vila do Conde e foram exibidos, entre outros, em Turim, Belfort, Montreal e Clermont-Ferrand. Sandro Aguilar foi alvo de retrospetivas no BAFICI e em Roterdão.
Mariphasa, a sua segunda longa-metragem, teve estreia mundial em 2018 na secção Forum do Festival Internacional de Cinema de Berlim.